平台常用软件使用说明
服务名称:平台常用软件使用说明
服务对象:全校师生员工
软件列表:
VASP(量化计算)
• 四大输入文件:INCAR / POSCAR / POTCAR / KPOINTS
• 加载:module load VASP/6.2.1
• 输出:OUTCAR(总能量)、CONTCAR(续算)、OSZICAR、XDATCAR
GROMACS / LAMMPS(分子动力学)
• GROMACS:gmx_mpi grompp + mdrun,输入 conf.gro / pme.mdp / topol.top
• LAMMPS:srun --mpi=pmi2 lmp_mpi -in in.lj
ANSYS / OpenFOAM / MATLAB(工程仿真)
• ANSYS:module load ansys/2024.R1,runwb2 / fluent
• OpenFOAM:module load OpenFOAM/2512(网格→求解→合并流程)
• MATLAB:matlab -batch "命令" 非交互执行
AI 计算环境
• Anaconda:module load anaconda/3-2023.03,source activate(禁 conda init)
容器 Singularity
• 构建:singularity build --sandbox
• 运行:singularity exec 镜像 命令
• 平台提供 fakeroot 专用节点
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